onsdag 30 januari 2013

ENCODEs förbannelse

ENCODE är ett vansinnigt ambitiöst projekt som har/håller på att kartlägga alla funktionella element i genomes (Encyclopedia of DNA Elements). Ett gigantiskt projekt där otaliga grupper samarbetar och utnyttjar olika metoder och cell typer för att förstå allt som händer i vårt DNA. En samling av resultat publicerades under förra året och dom är fantastiska att läsa.

Men en konsekvens av detta blir att du idag inte kan göra en genetisk eller genomisk studie utan att använda encodes data. Om du arbetar med GWAS data har du plötsligt ett hav av data för att annotera dina genetiska varianter: Är dom överrepresenterade bland aktiva regioner i T-celler? Är dom överrepresenterade bland regioner som binder vissa transkriptionsfaktorer? Data du kan använda för att annotera enskilda varianter bättre, eller i globala analyser. Helt underbart juh!


Men så sjukt mycket fler analyser att göra!!!

onsdag 23 januari 2013

Intressanta fakta

Viktigaste anpassningen min kropp genomgått under de senaste tre åren: Jag kan numera äta godis och kakor tidigt på förmiddagen utan att må illa.

måndag 21 januari 2013

Kan man dumpa stressen?

Är det inte ett otroligt lyxproblem som vi alla går och tampas med dagligen: Livspusslet. Här är jag, en DINKy på 30+ som fortfarande inte hinner slipa farfars gamla skrivbord, montera upp skostället, montera ihop bokhyllan, olja bänkskivan, vara tillräckligt social, träna 4 ggr i veckan eller jobba tillräckligt. Vad är det som är så otroligt viktigt egentligen? Hur fick mamma det att gå ihop med fyra barn, all städning, matlagning och bakning? Småbarnsfamiljen jag känner idag hinner inte ens laga mat på Söndagar. Men har mycket vill ha mera, vi vill ha allt vad det verkar. Och det verkar så förbenat korkat, detta uppskruvade liv vi lever. Och ovärt. Dessutom ska vi laga slow-food och springa maraton, någon gång där efter att jag slutar jobba vid 19 antar jag. Har inte denna text skrivits en miljard gånger redan?

Alltså, det rer sig ju. Jag vill inte säga djupa saker om vad som gör livet värt att leva, hur en borde prioritera, vad som förgyller mitt liv. För det har sagts förut och kommer sägas igen. Jag vill bara släppa det. Vart kommer denna press ifrån, där andras åsikter som allt från kroppsbehåring, möblemang, musiken jag lyssnar på och huruvida jag-äter-min-medhavda-mat-ur-plastlådan liksom spelar roll. Varför? Här är jag, epidemiologen, som allt mer hatar det faktum att allt du gör can and will be used against you i avgörandet om din skuld. Skulden för dina hälsoproblem, skulden för dina barns hälsa, skulden för vad vi gör med bollen vi bor på. Alla val, all information, all kunskap, allt vi ska göra för att det ska se ut som ett värdigt liv. Jag vill bara släppa det.


Köttfritt

Nyårslöfte nummer två är att ungefär hälften av all mat jag äter och lagar ska vara vegetarisk. Och det gläder mig enormt att jag idag har lätt att hitta inspiration och recept för vegetarisk mat som smakar gott. (Ikväll vankas chili med valnötter, rött vin samt choklad.) Kanske kan detta hjälpa mitt dåliga världssamvete något dessutom.

måndag 7 januari 2013

När dimman lättat

Mitt nyårslöfte är att inte packa/renovera/flytta i samband med nästa jul/nyår.

Och att ta till ordentligt med tid om jag får för mig att bredspackla i framtiden.

Hej 2013! Hejdå 2012, du ganska miserabla år med stora ljuspunkter.